Direction la site http://www.ubuntu-fr.org/ pour regarder ce que préconise la documentation et j'ai suivi les pages suivantes :

La première manipulation a été de supprimer via le gestionnaire de paquet ceux qui sont non installés :

Graphiquement Aller dans synaptic, choisir le mode d'affichage des paquets par etat et sélectionner les paquets non installés (résidus de configuration), puis sélectionner un des paquets non installés puis faire un Ctrl+A pour les sélectionner tous et choisir l'option supprimer complètement.

Ce qui donne ça :

nettoyage-02.png

Mais finalement, ça fait gagner peu de place :

nettoyage-03.png

Je me suis ensuite intéressé à la suppression des anciens noyaux. Vous pouvez utiliser la commande :

dpkg -l | grep -Ei "linux-headers|linux-image"
Et j'en avais un nombre certain ...

nettoyage-04.png

Pour les supprimer, il faut utiliser (pour chacun) la commande suivante :

sudo apt-get remove linux-headers-3.5.0-17 linux-headers-3.5.0-17-generic linux-image-3.5.0-17-generic linux-image-extra-3.5.0-17-generic --purge

Je garde les 2 dernières version (au cas où). Après, suppression, j'ai gagné énormément de place : 4,71Go

nettoyage-05.png

Donc même s'il n'y a pas d'impact sur la performance, il est parfois nécessaire de faire un peu de nettoyage, surtout si vous avez limité la taille de la partition root.